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    研究獲取CLL相關(guān)基因和突變的功能圖譜

    2014-03-03 10:57 閱讀:2397 來源:生物通 作者:孫福慶 責任編輯:云霄飄逸
    [導讀] 這一項目是西班牙慢性淋巴細胞白血病基因組聯(lián)盟的最新成果,該聯(lián)盟曾鑒定了涉及慢性淋巴細胞白血病發(fā)展的主要突變,但當時他們還不清楚這些突變的功能。

        巴塞羅那基因組調(diào)控中心Dr. Roderic Guigó領導研究團隊,對慢性淋巴細胞白血病進行了轉(zhuǎn)錄組分析,獲得了慢性淋巴細胞白血病相關(guān)基因和突變的功能圖譜。這項工作發(fā)表在Genome Research雜志上。

        這一項目是西班牙慢性淋巴細胞白血病基因組聯(lián)盟的最新成果,該聯(lián)盟曾鑒定了涉及慢性淋巴細胞白血病發(fā)展的主要突變,但當時他們還不清楚這些突變的功能。

        白血病是一種造血系統(tǒng)的惡性腫瘤,俗稱“血癌”,是最常見的惡性腫瘤之一。白血病按細胞分化程度可分為急性和慢性兩大類。根據(jù)受累的細胞類型,又可以分為粒細胞、單核細胞、淋巴細胞白血病等。其中慢性粒細胞性白血病(CML)占13%,急性粒細胞性白血病(AML)占28%,慢性淋巴細胞白血病(慢性淋巴細胞白血病)占30%,急性淋巴細胞白血病(急性淋巴細胞白血病)占13%,其他不典型的占17%.

        慢性淋巴細胞白血病慢性淋巴細胞白血病起病緩慢,在這種疾病中一些免疫功能不全的淋巴細胞發(fā)生了惡性的增生。慢性淋巴細胞白血病在歐美白種人中比較常見,患者的發(fā)病年齡大多在50歲以上,30歲以下的患者很少見。這種疾病的主要表現(xiàn)是全身淋巴結(jié)腫大,脾大,貧血及外周血中淋巴細胞異常增多。

        慢性淋巴細胞白血病的臨床和生物學表現(xiàn)差異很大。全基因組測序或全外顯子組測序可以為人們揭示慢性淋巴細胞白血病中的主要突變,而RNA測序能為人們展示慢性淋巴細胞白血病的轉(zhuǎn)錄譜。在這項研究中,研究人員對98名患者的白血病細胞和健康B淋巴細胞,進行了深度RNA測序。

        他們發(fā)現(xiàn)在慢性淋巴細胞白血病和正常B細胞之間,有數(shù)千個轉(zhuǎn)錄元件發(fā)生了差異性的表達,其中包括蛋白編碼基因、非編碼RNA和假基因。轉(zhuǎn)座元件在慢性淋巴細胞白血病中全面擺脫了細胞對它們的束縛。此外,有兩千個基因表現(xiàn)出慢性淋巴細胞白血病特異性的剪切模式。研究顯示,慢性淋巴細胞白血病中涉及代謝通路的基因得到了更高水平的表達,而剪切體、蛋白酶體和核糖體相關(guān)基因被明顯下調(diào)。

        在此基礎上研究人員將慢性淋巴細胞白血病患者分為兩個亞類,一組在較長時間之內(nèi)不需要治療,而另一組則需要迅速進行治療。進一步分析顯示,這兩組患者之間的差異,來自于淋巴結(jié)微環(huán)境中的B細胞受體激活。

        “我們在對基因組進行功能性分析的基礎上,區(qū)分了兩個不同的慢性淋巴細胞白血病患者群體。在這兩組患者之間慢性淋巴細胞白血病的侵襲性差異很大。理解這種差異背后的分子機制,可以幫助人們?yōu)槁粤馨图毎籽』颊咛峁└鼈€性化的治療,”Dr. Guigó說。

     


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