Barrett食管的病因至今尚不完全清楚。盡管有關(guān)Barrett食管與胃食管反流之間的關(guān)系已被大多數學(xué)者接受，但Barrett食管確切的發(fā)病機制仍不清楚。之所以這樣說(shuō)是因為在胃食管反流病人中，只有10%發(fā)展為Barrett食管，而90%的患者并不發(fā)生變化。長(cháng)期以來(lái)一直存在著(zhù)兩種學(xué)說(shuō)，即先天性學(xué)說(shuō)和獲得性學(xué)說(shuō)。

    1.先天性學(xué)說(shuō)

    先天性學(xué)說(shuō)認為Barrett食管是由于人體胚胎發(fā)育過(guò)程中柱狀上皮沒(méi)有被鱗狀上皮完全替代所致，因此食管下段遺留下胚胎時(shí)期的柱狀上皮。一些臨床觀(guān)察也支持先天性學(xué)說(shuō)。

    2.獲得性學(xué)說(shuō)

    有研究認為Barrett食管是一種獲得性疾病，它與胃食管反流性疾病有密切關(guān)系。食管下段長(cháng)期暴露于酸性溶液、胃酶和膽汁中，造成食管黏膜的炎癥和破壞，導致耐酸的柱狀上皮替代鱗狀上皮。研究證實(shí)，大多數Barrett食管病人存在反流性食管炎。

    關(guān)于Barrett食管柱狀上皮的來(lái)源尚未定論。目前有幾種看法：①來(lái)源于鱗狀上皮的基底細胞；②來(lái)源于食管賁門(mén)腺體細胞；③來(lái)源于胃黏膜或原始干細胞。